Волейбольный клуб «Зенит» (Санкт-Петербург) основан летом 2017 года при поддержке ПАО «Газпром». Директором стал Заслуженный тренер России, Мастер спорта международного класса, Заслуженный работник физической культуры РФ Владимир Самсонов. С 15 января 2024 года клуб возглавил Анатолий Хайбулкин, ранее исполнявший обязанности заместителя директора.

23 июня 2017 года по итогам заседания Президиума Всероссийской федерации волейбола волейбольный клуб «Зенит» (Санкт-Петербург) был включен в состав участников Суперлиги мужского чемпионата России.

Домашние матчи команда проводит в КСК «АРЕНА» и в Академии волейбола Платонова.

Главным тренером «Зенита» стал Александр Климкин. В бытность игроком он трижды становился чемпионом России. В качестве тренера входил в штаб сборной России с 2011 года и по настоящий момент. Главные победы – на Олимпиаде-2012 и в Мировой лиге-2013. В 2015 году исполнял обязанности главного тренера национальной команды.

В первом же сезоне «Зенит» выиграл серебряные медали — это лучший результат в истории для новичков Суперлиги. В следующем сезоне сине-бело-голубые дошли до финала Кубка России.

Перед сезоном-2019/20 команду возглавил главный тренер сборной России Туомас Саммелвуо. Под его руководством зенитовцы вновь пробились в финал национального кубка. Также команда дошла до полуфинала Кубка ЕКВ, однако из-за пандемии коронавируса COVID-19 победители еврокубков не были определены. Чемпионат России также не был доигран, места распределялись в соответствии с итогами регулярного первенства.

Летом 2020 года команду пополнили несколько звездных новичков — лидеры сборной России доигровщик Егор Клюка (он стал капитаном «Зенита») и диагональный Виктор Полетаев, связующий сборной Франции Антуан Бризар. Также в рамках курса на омоложение состава клуб подписал талантливых юных игроков — либеро Сергея Мелкозерова, центрального блокирующего Максима Космина, доигровщика Омара Курбанова. Перешел в «Зенит» один из сильнейших блокирующих Суперлиги — Дмитрий Пашицкий. В сезоне 2020/2021 команда стала второй сразу в трех турнирах: чемпионате страны, Кубке России и Кубке ЕКВ.

Серебро Суперлиги Париматч гарантировало «Зениту» участие в Лиге чемпионов в сезоне 2021/2022, перед которым клуб полностью обновил пару легионеров: в Санкт-Петербург перебрались олимпийский чемпион Токио, либеро сборной Франции Женя Гребенников и неоднократный призер чемпионата Европы в составе сборной Словении Тине Урнаут. Кроме этого, в «Зенит» пришли Игорь Кобзарь, Федор Воронков и Игорь Колодинский. По ходу сезона в команде сменился главный тренер: на этом посту Андрей Толочко заменил Туомаса Саммелвуо. В чемпионате России команда сумела пробиться в полуфинал, но затем уступила последовательно московскому «Динамо» и казанскому «Зениту», оставшись в итоге на 4-й позиции в Суперлиге.

В августе 2022 года «Зенит» представлял Санкт-Петербург на I Всероссийской Спартакиаде сильнейших, завоевав серебряные медали. Активное участие в этом турнире приняли игроки, пополнившие нашу команду перед началом сезона — вернувшийся в «Зенит» связующий Дмитрий Ковалев и центральный блокирующий Егор Якутин.

В феврале 2023 года новым главным тренером “Зенита” стал Виктор Владимирович Сидельников. В PARI Суперлиге-2023 команда заняла четвертое место, уступив в серии за бронзу новосибирскому “Локомотиву”. По итогам сезона клуб покинули Кирилл Урсов, Сергей Мелкозеров и Егор Якутин. В межсезонье к “Зениту” присоединились Семен Кривитченко, Андрей Ананьев, Алексей Сафонов и Андрей Титич. А уже по ходу чемпионата России клуб пополнили Владислав Бабкевич, Евгений Сивожелез и румынский легионер Александру Рацэ.

По итогам сезона 2023/2024 «Зенит» занял 6 место. В межсезонье клуб активно укомплектовывал состав. В мае 2024 года сине-бело-голубые подписали двухлетний контракт с новым главным тренером, им стал Владимир Романович Алекно. Также команду пополнили связующие Игорь Тисевич, Слави Костадинов и Александр Бутько, диагональный Павел Юринский, доигровщики Марлон Янт, Станислав Динейкин и Максим Богатко, а также блокирующие Василий Тарасенко и Денис Черейский.